Река Сема -находится в Онгудайском и Шебалинском районах. Это левый приток реки Катунь. Длина реки 73 км.
Река Сема берет начало от Семинского перевала. Семинский перевал разделяет долины рек Туэкта и Сема. В месте впадения Семы в Катунь, рядом с селом Камлак находится Горно-Алтайский ботанический сад.
На всем протяжении реки тянется Чуйский тракт, то идело пересекая реку. Сема имеет множество притоков. Недалеко от истока в Сему впадает правый приток - река Сарлык, которая стекает со склонов одноименной горы.
Правые притоки реки Сема (от истока к устью): Река Верх.Кумалыр, Ниж.Кумалыр, Седлушка, Покатайка, Кислая, Марчела, Черная Мыюта, Крешта, Актел, Шергаил, Едрала, Сосновая. Левые притоки (от истока к устью): река Топучка, Кысмаин, Куяхтанар, Гордуба, Арбайта, Чергушка, Барсуган, Куюла, Акташ, Улус-Черга, Актел.